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微生物發酵飼料所用菌種及應用方式
生產微生物發酵飼料的首要問題是選擇合適的菌種。2013年我國農業部2045號公告《飼料添加劑品種目錄》中規定在飼料以及飼料添加劑中可用的微生物菌株共計35種，但目前微生物發酵飼料最常使用的菌種為酵母菌、乳酸菌、芽孢桿菌等。
1.酵母菌
飼料用酵母菌主要分為熱帶假絲酵母、產阮假絲酵母、釀酒酵母、紅酵母、畢赤酵母等。飼料酵母因其含有較高的粗蛋白質、氨基酸及多種維生素，同時含有多種動物所需的消化酶（α-淀粉酶、蛋白酶、纖維素酶、半纖維素酶等），對營養物質的消化吸收起著重要作用。酵母細胞還可以直接和腸道中的病原體結合，中和胃腸中的毒素。同時酵母菌具有濃烈的酵母香味，對家畜增加食欲、增強消化吸收等有一定作用。
2.乳酸菌
乳酸菌可提供營養物質，直接促進動物生長，改善消化道微生態環境，調節消化道免疫系統。其作用機理是乳酸菌進入腸道后會形成優勢菌種，從而抑制病菌的繁殖，并且自身可以產生多種抑菌物質，抑制或殺死病原微生物，從而增強機體免疫功能，提高機體抵抗力，最終改善畜禽的生長性能和飼養環境。乳酸菌還可以提高飼料的品質，提升家禽對飼料的利用率，與傳統的抗生素、化學添加劑相比，具有無污染、高效、安全的優點。
3.芽孢菌
芽孢桿菌具有較強的淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶活性，同時還可降解植物性飼料中的纖維素、半纖維素和木質素等，可明顯促進動物對營養物質的消化吸收，進而提高飼料利用率。芽孢桿菌還可以消耗大量的氧，維持腸道厭氧環境，抑制致病菌的生長，維持腸道正常生態平衡，增強機體免疫力。我國已應用于生產的需氧芽孢桿菌主要有蠟樣芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌和巨大芽孢桿菌。
目前可用于微生物發酵飼料生產的菌種趨向菌株的協同發酵，利用兩種或兩種以上微生物同時添加酶制劑協同作用，微生物和酶制劑之間協同增效，功能互補。但配伍時要注意菌、酶品種少而精，并要求在同一保存體系下能有協同作用，從而保證菌和酶都能發揮作用。
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